时间同步误差通常都用时间间隔计数器来测量。用参考秒信号作开门信号，而用被测秒信号作关门信号。当被测秒信号迟后参考秒信号时，时间间隔计数器显示的即时间同步误差的值;而当被测秒信号超前参考秒信号时，时间间隔计数器显示的是-1时同步误差1.这一点在测试时要注意。时间同步误差一般由站间时间同步误差，站内时间同步误差和时间码接口终端时间同步误差等3部分组成。这些误差的产生原因，测试方法不尽相同。

　　站间时间同步误差由授时误差，时间同步手段误差和时统设备误差三部分组成。授时误差只有在时统战分布较广，时统战接收不同授时台发播的时间，并且同步误差要求很高时(< 1us)才予以考虑。在一般情况下，授时误差受到授时台的精密控制，其值很小，可以忽略不计。时间同步手段误差是站间时间同步误差的主要误差源。由于站间距离较远，一般均无法直接测量站间时间同步误差，而需要间接的测量方法来获得站间时间同步误差。

　　用搬运钟的秒信号作为参考秒信号来分别测量个站时统设备秒信号与其时差，然后再依此计算站间时间同步误差。由于采用这种测试方式。搬运钟需经受较为苛刻的要求，通常都用较为轻便的原子钟作为搬用钟。这种方法要求搬运钟的守时误差源小于所测得站间同步误差。当这一条件不能很好满足时，可采用分批的方法以缩短每次测试持续时间，这样可以放宽对搬运钟守时误差的要求。