NTP服务器双混频时差法的工作原理参考频率标准输出的f0和被测频率标准输出Fx信号，通过两个双平衡混频器分别于来自公共振荡器输出的Fc信号进行混频。公共振荡器的输出Fc= F0-F,F 为拍频信号的频率，其值根据测试需要而定。如测秒以上稳定度，F=1hz;如测秒以上的稳定度，F=1KHZ。

公共振荡器的误差部分在双平衡时差测量中被抵消，因此可降低对公共振荡器的要求。公共振荡器可采用固定频率F0-F 的振荡器，也可采用F可变的频率合成器，这样测量时就更为灵活。从双平衡时差法测量原理可知，它不需要将参考频率标准的频调偏于被测频率标准的频率，这对于频率不易调偏的原子频率标准频率稳定度的测试更为适宜。

移相器的作用是调整被测信号fx的相位，使两个混频器输出的拍频信号的相位标称值尽量接近。混频器输出的拍频信号经低通滤波后送入放大整形电路，该电路的拍频信号的正交过零点处形成前沿陡峭的触发信号送时间间隔计数器。时间间隔计数器测量两路输入信号之间的时差，用于频率稳定度计算。

如上所述，双混频时差法是一种很容易实现阿仑方差测量所需无间隙连续取样的频率稳定度测量方法，而且其对时间间隔的测量也不需要很高的精度。它是一种高精度的频率稳定度测量方法，常应用于原子频率标准的测量。